La cueva inicia en donde finaliza un arroyo de temporal que vierte las aguas de la Sierra del Abra-Tanchipa al interior de la montaña y cuyo cauce ha formado por milenios una serie de galerías y pasajes subterráneos en la roca sedimentaria que forma estas montañas (formación el Abra). El inicio de la caverna presenta una caída vertical (tiro de entrada) de alrededor de 15 metros. La cavidad se abre imponente en una pared de alrededor de 50 m por donde un par de pasajes se introducen al interior de la montaña. Al pasaje superior se accede desde lo alto de la pared en un meandro estrecho que serpentea y se une al pasaje principal a unos 700 metros adentro en la montaña. En sus túneles y galerías se han formado bellos espeleotemas de diversos tamaños, desde estalagmitas del tamaño de una casa hasta otras formaciones más pequeñas pero muy peculiares como lo es la "flor de piedra". Las crecidas de agua que penetran en la gruta han acarreado consigo escombros de vegetación, lodo, rocas y enormes troncos atravesados en los primeros centenares de metros.

Aproximadamente a la mitad de la gruta se encuentra un enorme salón con forma triangular desde el cual se continúa por pasos parcialmente inundados hasta una poza profunda llamada "El lago de metano". Aquí es posible encontrar burbujas de gas metano ascendiendo por la superficie de la poza. Las formas de roca caliza muestran una singular belleza cristalina y los túneles continúan hasta los casi 100 m de profundidad por una serie de tiros cortos. En lo más profundo de la caverna el oxígeno comienza a disminuir en concentración y se hace presente el gas dióxido de carbono por lo que para la exploración de las galerías más profundas es necesario tener cuidado con el aire enrarecido.